Quá trình thanh toán được thực hiện tự động thông qua các cổng thanh toán uy tín tại Việt Nam như VNPay. Người mua khi thực hiện thanh toán để mua hàng sẽ được chuyển đến trang thanh toán của cổng thanh toán. Các cổng thanh toán này hoạt động hợp pháp tại Việt Nam với đầy đủ các chế độ bảo mật. Vì vậy, người mua hoàn toàn yên tâm rằng các thông tin này được các cổng thanh toán xử lý theo đúng quy trình bảo mật thông tin. Cũng cần lưu ý rằng Groupee không thể có và không lưu giữ những thông tin thanh toán này (thông tin tài khoản, thông tin thẻ tín dụng…).